基金管理中心
基金管理中心是清潔基金的日常管理機構，具體負責基金的籌集、管理和使用工作，由財政部歸口管理。
一、中心領導
莫小龍：黨委副書記、紀委書記
楊劍敏：黨委委員、副主任
夏穎哲：黨委委員、副主任
二、業務部門
基金管理中心內設7個業務部門：即黨委辦公室（人事部）、推廣開發部、項目投資部、風險績效部、信息管理部、財務部、政策研究部。
基金管理中心各部門業務分工如下：
（一）黨委辦公室（人事部）。主要負責黨務工作、公文運轉、人事管理、法務管理、外事管理、后勤管理、基層組織建設及按國內采購制度開展采購工作。
（二）推廣開發部。主要負責協助政府篩選適用PPP的行業、選擇合適的PPP模式、制定規范的項目流程，推動開展PPP示范項目建設，為政府和社會資本在項目識別、準備、采購、執行、移交等環節提供技術支持；開展與國內外金融組織和機構的合作，推動PPP項目融資便利化等。
（三）項目投資部。主要負責清潔基金有償使用項目的開發、投資和管理，同時承擔清潔基金有償使用項目投資評審委員會秘書處工作。
（四）風險績效部。主要負責清潔基金（PPP中心）風險防控體系構建；PPP項目的風險和績效管理；清潔基金有償使用和現金理財業務的風險和績效管理，同時承擔清潔基金有償使用項目風險管理委員會秘書處工作。
（五）信息管理部。主要負責清潔基金網站和PPP中心網站的運行和維護、項目庫和專家庫的管理、編制PPP年度報告、編制基金年報、宣傳出版物的編制、對外信息發布與宣傳工作等。
（六）財務部。主要負責中心財務預決算編制匯總、會計核算、財務管理、現金理財、資產管理；清潔基金國家收入收取，贈款項目管理；牽頭與清潔基金審核理事會的溝通協調工作；承擔與上海環境能源交易所的協調管理工作。
（七）政策研究部。主要負責收集整理國內外PPP相關的政策理論與案例分析；研究PPP項目的物有所值、政府采購、預算管理、風險控制、財政承諾等以及其他相關政策法規問題；負責清潔基金業務領域有關政策研究和業務創新等。
